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『Bio Big-AnalysysPac RMS』は、大量生物情報を格納するためのストレージサーバです。 大量データを格納するための大規模ストレージサーバをラックマウントで提供。 ご用命の際は、当社へお気軽にご相談ください。 【仕様例】 ■Storage(本体)：20TB 6Gb/s SATA HDD(高耐久性)×16台 RAID6 総実容量 訳252TB(20TB×(16-2)×0.9) ■HDD Bay：(3.5")：[Hot Swap Bay for SAS/SATA HDD]20TB SATA HDD×16nays ■IPMI：IPMI(Intelligent Platform Manegament Interface) for Remoto System Power on/off and system monitoring ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
『Ansrch』は、複数で膨大なアノテーション情報をWebシステムとして提供する遺伝子カタログデータベースです。 リッチなアノテーションを整理整頓し、簡単に検索・参照が可能。 Webブラウザを使って参照するシステムですので、組織内はもちろんのこと、 複数の研究者で情報を共有していただくことができます。 【メリット】 ■Gene prediction ・発現量に関係なく予測 ■RNA-seq ・得られた核酸配列はリアルな転写配列(発現のエビデンスがある) ・UTRがある ・転写開始点を得られる可能性が高い ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
（１）NCBI-nrへのBLASTによるアノテーションの付与 （２）OrthologDBであるEggNOGによるアノテーション （３）Interproによるアノテーション （５）RNA-seq リード の利用
PacBioが出力するロングリード配列を利用して、Assembleパイプラインを実行することにより、染色体に近づくような高品質なContig配列が得られます。 さらに、Phasing（アレルごとのContigが分離されて出力される）やScaffoldingも実現できるようになっています。 ・最新の技術を使用して、ゲノム配列のassemblyや遺伝子予測、機能注釈を含めたリファレンスデータの作成を行います。 ・生物種により、必ずしも同じ手順で、期待通りの結果をなるとは限らず、データ解析の各段階で評価を行いながら手法を検討して進めます。 ・出力結果を検索参照できるWebシステムも提供します。
当社は、シーケンシング、候補遺伝子の絞り込み、データ評価のプロセスを カバーする『次世代型シーケンサ受託解析サービス』を行っています。 豊富な知見をもとに、研究テーマに合わせた解析方法の選定をはじめ、 解析後のデータ評価も含め、専門スタッフがサポート。一貫したサービスにより、 お客様の研究成果に繋がるソリューションを提供可能です。 【特長】 ■次世代型シーケンサによる受託解析方法を検討・実施 ■高品質なシーケンシングと高度なデータ解析。多用な解析オプションも用意 ■研究目的に応じた遺伝子リストを提示し、研究進行をスムーズに ■BLAST検索やID検索ができるプログラムも提案可能 ※詳しくは資料をご覧ください。お問い合わせもお気軽にどうぞ。
次世代シーケンサから得られたプライベートなmRNAやGenome、アミノ酸の配列に対して、WindowsやMacなどのモバイルPC上で、BLAST検索作業を簡単に行うことができるアプリケーションです。 ・インストーラで簡単インストール ・すべての機能をマウスで操作 ・複数の配列セットをデータベースとして登録 ・複数のクエリ配列とそのBLAST結果を保存 ・BLAST結果をPDFで出力、印刷 ・３０日間無料でBLAST可能 ・ライセンスが切れても、BLAST検索結果の参照は可能です。 ・BLAST結果を見るだけであればライセンスは必要ありません。
『微生物ゲノム株間比較サービス』は、PacBioにより得られたほぼ完全長のコンティグ配列を使用して比較を行うサービスです。 構造を外観してどの程度の違いがあるのかを確認し、 その上で違いのある領域（SNP、IN/DEL、Inversion、translocation)の遺伝子を提示し、 さらに、アミノ酸配列の違いなどを提示します。 遺伝子予測情報は、２種類の予測パイプラインの結果をマージしたものを納品します。 また、オプションで、機能アノテーションについても、３種類のデータを提供することができます。 【解析内容】 ■ゲノム配列を読む ■近縁株間のゲノム比較 ■発現変動遺伝子を見つける 詳しくはカタログをご覧頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。
