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パトコア株式会社

設立2003年2月
資本金2000万
住所東京都千代田区丸の内1-7-12 サピアタワー26F
電話03-6256-0331
  • 公式サイト
最終更新日:2024/05/29
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機械学習モデルの構築/予測ツール『Trainer Engine』

学習~モデルの共有のライフサイクルをシンプルに!生物活性や物理化学的特性の予測を組織に展開し、効率的にルーチン化!

「Trainer Engine」は、高精度の予測モデルを構築・展開し、隠された化学構造と活性値などとの関係性を見出すことができます。 また、各種機械学習アルゴリズムに対応しており、化学データを自動的に正規化して高性能な記述子を生成します。最も重要な統計パラメータは回帰と分類の両方のケースで計算されます。 再現性と可視化にも優れており、モデルをリポジトリに一元管理することで、再現性が確保されパラメータの比較を容易にします。分析ビューの表示形式も各種用意があるので、目的に応じて設定が可能です。 【特長】 ■データの取り込み~検証済みモデルの組織内展開までカバーする網羅性 ■構造式の標準化と高品質でカスタマイズ可能な記述子を利用する聡明さ ■モデル最適化のための豊富なフィードバックと可視化可能な利便性 ■セントラルリポジトリで採用モデルの選定を支援する再現性 ■内臓のグラフィカルインターフェース、その他デザインプラットフォームから予測機能にアクセス可能な統合性 ■生物活性、ADMET、物理化学的性質の予測が可能

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【化学物質管理ソリューション導入事例】エーザイ株式会社様

複雑化する化学物質の管理の課題をトータルに解決!

パトコア株式会社が取り扱うシステムを導入した事例をご紹介します。 エーザイ株式会社様は、化学物質の取り扱いに関する法規制が強化されるなか、 化学物質の合成、化合物の購入および輸出入を含む授受などを実施する前に 法規制の有無を判断する必要性が高まってきていました。 そこで、法規制物質チェックシステム「CRAIS Checker」をはじめ、 「CRAIS Reagent」や「SMARTS」を導入。 結果、複雑化する化学物質の管理の課題をトータルに解決できました。 【導入製品】 ■CRAIS Checker:法規制物質チェックシステム ■CRAIS Reagent:試薬管理システム ■SMARTS:試薬カタログデータベース ■Plexus Connect:Webベースの創薬研究基幹システム ※詳しく関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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法規制物質チェック『クレイスチェッカークラウド』

クラウドで構造式から法規制を瞬時にチェック! 複雑で頻繁に改正される化学物質規制の対応をより簡単・確実に!

「クレイスチェッカークラウド」は、製薬・化学企業様に広くご愛顧いただいている、法規制チェックシステムCRAIS Checkerを手軽に利用できるようにしたクラウド版です。 ネットに繋がったパソコンさえあれば、即、構造式を描画して、抵触する法令を瞬時に確認できます。 自社内にシステムを設置するのに比べ、ハード投資や運用管理を行うIT担当者も不要ですので、ベンチャー企業や小規模な化学品輸入商社などでも、簡単且つリーズナブルに化学物質管理法令の遵守体制を強化・効率化できます。 対応している法令や法令チェックの精度はCRAIS Checkerと同様で、新規物質や包括規制などにも対応しています。 ◆NEW◆ 作業記録等の30年間保存が必要ながん原性物質に対応 【特長】 ■誤判定の極めて少ない高精度の法規制物質確認を実現 ■豊富なユーザーベースに支えられた高い信頼性 ■迅速な法改正対応 ■様々な表記の化学構造式を正確に処理 ■曖昧な規制構造・包括規制に対応 ■電子実験ノートや試薬管理など社内システムと容易に連携可能 ※詳しくはカタログをご覧頂くか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『Pipeline Pilot Component』

ChemAxonの機能をPipelinePilotに統合!16種類のChemAxonツールへのアクセスを提供

ワークフロー管理システムは、データマイニング、データ処理、 統計分析といった複雑なコンピュータータスクを簡単に設計し、 実行できるようデザインされています。 Pipeline Pilot 用『Component Collection』は、ChemAxonの 化学情報処理機能をPipelinePilotでご利用頂く為のコンポーネントです。 16種類のChemAxonツールへのアクセスを提供しています。 【Pipeline Pilotとは】 ■ダッソー・システムズBIOVIA社のワークフロー管理システム ■迅速なデータアクセスや視覚化が可能 ■研究開発組織でのモデリングやシミュレーション、情報科学、  科学的ビジネスインテリジェンスニーズに柔軟に対応 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『JChem extensions for KNIME』

ChemAxonの機能をKNIMEに統合!分析プロセス全体の使いやすいグラフィカルなワークベンチ

『KNIME』は、データアクセス、データ変換、初期調査、強力な予測分析、 ビジュアライゼーション、およびレポート作成など、分析プロセス全体の 使いやすいグラフィカルなワークベンチです。 創薬分野に限らず一般的な目的で設計されており、基本的なセットアップには 多くの分野で共通の機能が含まれていますが、同時に多くのケムインフォマ ティクスおよびバイオインフォマティクス関連の拡張ツールがあり、 とくに創薬初期で有用な化学構造管理や分析などに広く活用されています。 【特長】 ■研究者がKNIMEワークフロー内でChemAxonツールを  活用できるようになる ■創薬分野に限らず一般的な目的で設計 ■とくに創薬初期で有用な化学構造管理や分析などに  広く活用されている ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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マーカッシュ構造データベース検索『Markush search』

DARC formatのインポート機能を実装!マーカッシュ構造のケミカルスペースを瞬時に検索

『Markush search』は、特許出願などに用いられるマーカッシュ構造を データベースに登録し、エニュメレーションすることなく、部分構造検索や 完全一致検索を実現するJChem Base、JChem Cartridgeおよび Instant JChem用のアドオンです。 Markush Enumeration pluginの2つのツールを用いることにより、 複雑なマーカッシュ構造の解析やマーカッシュ構造によって記述された ケミストリースペースのブラウジングを格段に容易にします。 また、DARC formatのインポート機能を実装しており、Tomson Reuters社の 提供する特許のデータベースMMSを利用することができます。 【特長】 ■部分構造検索や完全一致検索を実現 ■ケミストリースペースのブラウジングを格段に容易にする ■DARC formatのインポート機能を実装 ■Tomson Reuters社の提供する特許のデータベースMMSを利用できる ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学特許半自動解析ツール『ChemCurator』

特許から構造や関連情報を効率的に抽出・データ化し、迅速に解析できます!

新薬開発を行う製薬会社において、他社特許でカバーされている ケミカルスペースを知ることは不可欠ですが、その作業は多大な 労力と人件費を要します。 また、特許には、膨大な数の実施例構造とアッセイデータが文書中に 散在しているだけでなく、広大なケミカルスペースを定義するために 複雑なマーカッシュ構造が使われています。 この解析をできるだけ自動化するため、ChemAxonが先端の技術開発を 進めている文書からの化学構造抽出技術Document to Structureと マーカッシュ構造関連技術の融合により『ChemCurator』が誕生しました。 【特長】 ■ドキュメント内のテキストやイメージから構造式を自動抽出 ■英語・日本語・中国語を認識 ■元の文書と抽出した情報をインタラクティブに表示 ■容易なナビゲーションと直観的な操作性 ■ドラッグ&ドロップで簡単にマーカッシュ構造を構築 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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文書から構造式抽出『Document to Structure』

特許文書の解析で特に威力を発揮!ドキュメント中の化学情報を簡単に抽出!

『Document to Structure(D2S)』は、ドキュメント中から様々な 化学情報を簡単に抽出するためのツールです。 “Non Text PDF”にも対応しているので、化学特許の解析業務を一気に 効率化することが可能。 特許文書の解析、文献の解析、ウェブサイトの解析、その他MS Office ドキュメントの解析などの用途にご利用いただけます。 【特長】 ■幅広い化学情報を認識 ■幅広いドキュメントフォーマットに対応 ■OCRの典型エラーを自動修正する独自のアルゴリズムで、より正確な変換を実現 ■ドキュメント中の記載位置まで特定できる ■画像PDFに対応することで、特許文書の解析で特に威力を発揮(外部ツールとの連携) ■Instant JChemやJChem for EXCELなど幅広いアプリケーションから利用可能 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学名から構造式に変換『Name to Structure』

IUPAC名,CAS番号,一般名から構造式を生成!テキストマイニングの自動化が可能

『Name to Structure』は、IUPAC名、CAS番号、一般名などから化学構造式を 生成する化学テキストマイニングツールです。 Molcovertやcxcalcなどのコマンドラインツールからも名称⇔構造変換ができ、 APIを用いてカスタムアプリケーションに変換機能を組み込むことが可能。 また、Document to structureはAPI及びコマンドラインから利用でき、 html、テキスト、PDFファイル内の化学名を認識し、構造式に変換します。 【特長】 <Document to Structure アドオン> ■化学名を認識し、構造に変換するだけでなく、ファイル内の  化学名の位置情報も取得可能 ■APIはフリーのchemicalize.orgに実装されており、Webページ内で  化学名を見つけ構造に変換するのに用いられる ■Knimeに統合されており、テキストマイニングの自動化が可能 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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構造式から化学名を生成『Structure to Name』

構造式からIUPAC名、一般名を生成!APIを通じてカスタムプログラムから利用可能

『Structure to Name』は、構造式から慣用名または2004年のIUPAC nomenclature recommendations(International Union of Pure and Applied Chemistry 、国際純正・応用化学連合)に基づく化学名を 生成する化学テキストマイニングツールです。 Marvin Sketch、Marvin View、コマンドラインツール(cxcalc)による バッチ計算、 ChemAxonケミカルターム(Chemical Terms)、Instant JChem からまたはAPIを通じてカスタムプログラムから利用することができます。 ご用命の際はお気軽にお問い合わせ下さい。 【特長】 ■構造式から慣用名または2004年のIUPAC nomenclature  recommendationsに基づく化学名を生成 ■Marvin SketchなどからまたはAPIを通じて  カスタムプログラムから利用可能 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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バーチャルリアクションエンジン『Reactor』

反応が起こる種々の条件を組み合わせ!合成可能なバーチャルライブラリーの作成

『Reactor』は、バーチャルライブラリーを作成するためのソフトウェアです。 単にバーチャルな分子を作るのではなく、化学的に意味があり、合成できる可能性の高い化合物を生成するユニークなアプローチを採用しています。 化学の専門家によって構築された230種以上の反応のライブラリが提供されており、すぐに利用できます。 この反応ライブラリは正確性と信頼性を確保するために、反復的に徹底的にレビューされています。 反応ライブラリには、検索や条件設定に用いる事ができるChemical Termが用いられr、反応性や選択制などを評価することで、合成できる可能が高い化合物のみを生成することが可能です。 【特長】 ■多段階反応のサポート ■シーケンシャルモード、コンビナトリアルモードでのバーチャル反応 ■各種ファイルフォーマットのサポート ■高速なバーチャルライブラリの生成 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化合物クラスタリング・MCS抽出ツール『JKlustor』

クラスタリングとダイバーシティ解析。ディスクリプター等に基づくライブラリの比較が可能!

『JKlustor』は、クラスタリングとダイバーシティ解析のコンポーネントです。 クラスタリングをはじめ、ダイバシティ計算、分子フィンガープリント、 共通部分構造、ディスクリプター等に基づくライブラリの比較を行うことが可能。 コンビナトリアルケミストリ、ドラッグデザインその他化合物ライブラリの 解析が必要な場面で利用できます。 【特長】 ■クラスタリング、ディスクリプター等に基づく  ライブラリの比較を行うことが可能 ■化合物ライブラリの解析が必要な場面で利用できる ■クラスタリングの手法や計算の最適化に関して  オプションを選択できる ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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Webブラウザ対応・構造エディタ『Marvin JS』

軽量なJavaScriptベースの構造エディタ及び構造レンダリングツールをご紹介!

『Marvin JS』は、様々なWebアプリケーションに組み込むだけで、多様なデバイス上に構造エディタ機能を提供できるツールです。 軽量な為、迅速に起動し、構造式や反応式をスピーディーに編集可能。 プラグインなどが一切不要な為、企業や学内のネットワークからもスムーズに利用することができます。 【特長】 ■様々なデバイス上に構造エディタ機能を提供できる ■構造式や反応式をスピーディーに編集可能 ■JavaRuntimeプラグインなどが不要 ■企業や学内のネットワークからもスムーズに利用可能 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学構造の不具合を検出修正『Structure Checker』

分子構造のエラー検出と修復!自動的な修正は様々な問題に対応しております

『Structure Checker』は、潜在的な問題の原因となり得る構造式の エラーを検出し、修復を行う化学構造のバリデーションツールです。 マニュアルモードも備え、問題のある構造を表示し、ユーザーが マニュアルで修正することも可能。 また、シンプルなウィザードによるガイドにより、詳細な設定が 容易なほか、合物登録システムなどの業務アプリケーションに 組み込んで利用することができます。 【特長】 ■構造式描画上のエラーをスキャンし、問題を修復 ■自動的な修正は様々な問題に対応 ■バリデーションレポートの生成も可能 ■シンプルなウィザードによるガイドにより詳細な設定が容易 ■コマンドラインでの利用やAPIの利用も可能 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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構造式標準化ツール『Standardizer』

構造表記の多様性の問題を解決!構造表記を標準化し取り扱いを容易にします

『Standardizer』は、構造式標準化のモジュールで、様々な表記方法の 構造式をルールに基づき標準的な表記方法に変換します。 メゾマーの変換をはじめ、トートマーの変換、グルーピングの解除、 塩、溶媒の除去などの機能を搭載。 データベースに登録された構造式を標準化することで確実で効率的な 検索が可能になります。 【特長】 ■様々な表記方法の構造式をルールに基づき  標準的な表記方法に変換 ■確実で効率的な検索が可能 ■様々な変換機能を搭載 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学基盤『JChem PostgreSQL Cartridge』

PostgreSQLに化学インテリジェンスを追加!パワフルなデータベースソリューション

『JChem PostgreSQL Cartridge』は、化学データベース管理および 構造検索の機能をPostgreSQLに付加するケミストリーエンジンです。 PostgreSQLに組み込むことでSQL言語を用いて化学データの ハンドリングが可能。 個人用データベースからエンタープライズレベルでのデータ管理に 適するスケーラビリティーと高コストパフォーマンスを併せ持つ 化学データベースエンジンとなっております。 【特長】 ■豊富な機能 ■信頼のおけるフリーデータベース管理システムで  化学構造管理を実現 ■スケーラブルな化学エンジン ■低コストでグループレベルのソリューションを提供 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学基盤『JChem Oracle Cartridge』

Oracleのネイティブな環境で高パフォーマンスな化学構造・反応検索を実現!

『JChem Cartridge for ORACLE』は、ユーザーがオラクルで様々な検索が 出来るようになる創薬ITプラットフォームです。 SQLのSELECT文において構造条件に加え、Calculator Pluginsを組み合わせて ご利用頂くとLogPなどの予測物性値などの条件を指定して検索が可能。 また、化学知識をORACLEに与えSQLによって化学構造式や化学反応式の検索や 構造式に基づく化学的な計算ができます。 【特長】 ■ユーザーがオラクルで様々な検索が出来る ■LogPなどの予測物性値などの条件を指定して検索が可能 ■化学知識をORACLEに与えSQLによって化学構造式や化学反応式の  検索や構造式に基づく化学的な計算ができる ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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構造検索エンジン『JChem Base』

様々なクライアントからアクセスが可能!高速かつ高度な構造/反応検索をサポート

『JChem Base』は、高速な検索アルゴリズムを搭載した構造検索エンジンです。 完全一致検索、部分構造検索、類似構造検索、スーパーストラクチャー検索、 反応検索、マーカッシュ(Markush)構造のハンドリングをサポート。 また、これらの検索時にはアトムリストをはじめ、ノットリスト、スーパーアトム、 水素数、芳香族/脂肪族原子などの複雑なクエリーを用いることができます。 【特長】 ■高速かつ高度な構造/反応検索をサポート ■様々なリレーショナルデータベースをサポート ■開発効率の高いAPIを提供 ■様々なクライアントからアクセスが可能 ■化学的パラメータの組み合わせ(ケミカルターム)による検索 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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構造描画ツール『Marvin Sketch』

直感的な操作で、構造・反応・クエリーの描画が可能!様々な構造データフォーマットをサポート

『Marvin Sketch』は、Javaベースの構造描画ツールです。 直感的な操作で、構造・反応・クエリーの描画が可能。 スタンドアロンの描画ツールとしての利用はもちろん、 Webアプリケーションやカスタムアプリケーションに 組み込んで利用することができます。 【特長】 ■直感的な操作で、構造・反応・クエリーの描画が可能 ■各種ファイルフォーマットの読み書きができる ■Chem Draw ProやISIS/Drawなどからコピーペースト可能 ■Marvinは様々な構造データフォーマットをサポート ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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MS-Officeに化学を!『JChem for Office』

Microsoft Office製品に化学機能を付加!パワフルで軽快な化学アドイン

ロングセラー化学アドイン「JChem for Excel」が、ExcelのほかにWord、 PowerPoint、OneNote、Outlookメールにも対応する『JChem for Office』 としてリニューアルしました。 Microsoft Office 2010、2013、2016に対応。 これまでのEXCEL化学アドインは、重く、安定性も不十分でしたが、 当製品を用いるとより軽快に大容量の化学データを便利に扱えます。 【特長】 ■Instant JChemで選択したプロジェクトのデータを読み込み可能 ■OracleやMySQLデータベースからデータセットをインポートできる ■Document to structureとの連携で、特許文書等からの  化学情報抽出にもご利用可能 ■バッチモードでJChem for EXCELワークブックをハンドリングするための  KNIMEノードやPPコンポーネントもご用意 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学構造を便利に!『JChem for Office Lite』

お気に入りの化学エディターで描画!異種の化学エディター利用者間でスムーズにコラボ

『JChem for Office Lite』は、軽快にMS Officeで「ライブ構造式」が 利用できるデスクトップアプリケーションです。 化学構造の表示や編集は、ユーザーのお気に入りの化学エディターを選択可能。 化学構造式をエディターからOfficeアプリケーションへコピー&ペーストしたいだけのユーザーに適しており、ペーストされた構造はJChem for Officeと同じようにシームレスに編集することができます。 【特長】 ■JChem for Officeのリボンと高度な化学関数オプションを 排除することで、軽く軽快に動作 ■与えられたフォーマットに好適なレンダラーが使われる ■構造のフォーマットに関係なく、レンダラー固有の描画スタイルが適用 ■レンダラーとエディターの変更はコンテキストメニュー項目から簡単にできる ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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骨格分類、SAR解析支援ツール『SARvision SM』

骨格は予めリストとして与えることが不要!読み込まれた化学構造式から自動的に生成

『SARvision SM』は、化学者にとって重要な仕事のひとつである 構造活性相関の検討を支援するソフトウェアです。 独自の最大共通部分構造(MCS:Maximum Common Substructure) 抽出エンジンにより化学構造データを骨格ごとに分類することができ、 SARの検討が容易。 骨格ベースのデータマイニングは、記述子ベースのクラスタリングに 比べて化学者の感性に近い評価が行え、スクリーニングデータの評価や Hit to Leadやリード最適化ステージでの合成戦略の立案などに力を発揮します。 【NEW!】 バイリガンドのSAR研究をルーチン化、かつ容易に実行できるPROTAC解析モジュールがリリースされました。 詳細は製品ページをご覧ください。 【特長】 ■構造式群から自動的に共通部分骨格を抽出し、  骨格ごとに分類したツリーを提示 ■骨格を物性や活性データでソートしたり、  スライダーを使った動的な絞込み ■豊富なグラフィック機能(棒グラフ、2D散布図、3D散布図) ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学データベース『Instant JChem Standard』

高速かつ高度な構造/反応検索をサポート!Mac,Windows,Linux対応のデスクトップ化学データベース

『Instant JChem Standard』は、化学情報をローカルデータベースで 管理する為のデスクトップアプリケーションです。 簡単な操作で化学データベースを構築し、インポート、エクスポート、 ブラウジング、構造/反応検索、編集が可能。 CalculatorPluginsのライセンスを追加すれば、pKaやlogPなどの 物性計算機能をInstanJChem内で利用でき、構造が登録された瞬間に 物性値も計算できます。 【特長】 ■簡単な操作で化学データベースを構築 ■インポート、エクスポート、ブラウジング、構造/反応検索、編集が可能 ■pKaやlogPなどの物性計算機能をInstanJChem内で利用でき、  構造が登録された瞬間に物性値も計算できる ■構造式の標準化機能組み込むことが可能 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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オンライン化学教育プラットフォーム『Zosimos(ゾシモス)』

生徒の答えを自動的に評価および採点!化学学習の為の仮想教室をご提供します

『Zosimos(ゾシモス)』は、インタラクティブな問題やチュートリアルの作成、答え合わせなどをオンライン上で実現し、化学や生化学の授業をより効果的にするデスクトップアプリケーションです。 卓越したChemAxonの化学情報基盤をベースとしており、構造式や反応式、バイオ分子を含む問題を提示したり、生徒の答えを自動的に評価および採点。 また、学生をプライベートな学習グループに招待して、評価を割り当てることができ、ノートPCやタブレットからWebアプリケーションとして利用できます。 【特長】 ■インタラクティブな問題やチュートリアルの作成、  答え合わせなどををオンライン上で実現 ■卓越したChemAxonの化学情報基盤をベース ■構造式や反応式、バイオ分子を含む問題を提示 ■生徒の答えを自動的に評価および採点 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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統合データブラウザー『Plexus Connect』

シンプルで直感的なユーザーインターフェースによる閲覧を可能にする科学情報プラットフォーム

『Plexus Connect』は、科学的なデータの表示・検索・分析を行うことが できるツール「Plexus Suite」で中心となるコンポーネントです。 Instant JChem(IJC)データベースに、マルチユーザーがウェブアクセスする 環境をご提供。IJCで生成したグリッドビューまたはフォームビューは、 大部分のIJCウィジェットをサポートしブラウザで開くことができます。 化学構造式と英数字データの閲覧・ソート・検索、およびクエリや検索結果の リスト保存が行えます。 【特長】 ■Plexus Suiteで中心となるコンポーネント ■大部分のIJCウィジェットをサポートしブラウザで  開くことができる ■化学構造式と英数字データの閲覧・ソート・検索、  およびクエリや検索結果のリスト保存が行える ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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構造アイディア提示システム『Transformer』最適化を加速

MMP解析などによって得られた置換ナレッジに基づき、構造改変アイディアを提示!

『Transformer』は、入力した構造をルールに基づき変換し、今まで思い付かなかった構造を自動生成する アイディア提示システムです。 “リード化合物のSolubilityなどの物性値を改良したい”、“ターゲットに対する生化学的特性を変化させたい”といった構造好適化段階の化合物設計において威力を発揮。 構造変換ルールベースとしてEMILを標準実装しているほか、ChEMBLデータベースやお客様が自社内で蓄積している 化合物ライブラリーのデータもインポートして活用することができます。 【特長】 ■入力した構造をルールに基づき変換 ■構造好適化段階の化合物設計において威力を発揮 ■構造変換ルールベースとしてEMILを標準実装 ■ChEMBLデータベースやお客様が自社内で蓄積している化合物ライブラリーのデータもインポートして活用可能 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『Markush Editor』DXで強力な化学特許を!

請求項の作成を支援し、多くの時間と労力を節約!強力で質の高いクレーム作成をサポート

先行例等と重複することなく、目的の化合物すべてを対象とする特許クレームを作成することは、大きな責任を伴い、とても困難な作業です。 『Markush Editor』は、Rグループ定義リストを使用し、マーカッシュクレームの文書を自動生成し、人的ミスを 回避することが可能な製品です。 すべての関連する置換基を正しくリストするという時間がかかり間違えの生じやすいタスクからあなたを開放し、クレームを完全な法的文言に仕上げることに集中できます。 【特長】 ■特許請求の起草とマーカッシュ解析を支援 ■Markushクレームの文書を自動生成 ■マーカッシュ構造の自動作成と編集 ■階層的なRグループ表現 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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ELNから実験項を自動作成『Quick Pat』で化学特許DX!

データチェック(化合物名、数値、略語)を省力化!実験項の作成を飛躍的にスピードアップできます

『Quick Pat』は、容易な操作で迅速に実験項作成ができる特許明細書作成支援システムです。 メンバーと同時に作業ができ、略語リスト、定型文を自動作成、論文作成(日/英)にも活用可能。 また、前任者からの引継ぎがスムーズで人材の流動化にも対応しているので、プロジェクト内のデータが把握できます。 【特長】 ■実験項作成作業時間の大幅短縮 ■ウィザードによる作業 ■豊富なデータチェック機能によるサポート ■オートテキストによる正確な入力アシスト ■チームの電子ノート、データベースが一望 ■ケミストとリアルタイムのデータ共有 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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革新的な創薬情報プラットフォーム『Design Hub』

Design HUBは仮説駆動型とデータ駆動型のアプローチを統合する、創薬のDMTAサイクルを効率化する画期的な情報基盤です。

Design HUBは、「仮説駆動型」および「データ駆動型」アプローチを統合し、創薬の早期段階におけるDMTA(Design, Make, Test, Analyze)サイクルを効率化するための画期的な情報プラットフォームです。コンテンツハブとしての機能も備え、創薬プロセス全体の効率化と成功率向上を実現します。さらに、社外のCROや大学とのコラボレーションを円滑に進めるためのセキュアな情報共有機能を提供し、プロジェクトタスクの効率的な推進をサポートします。 【特長】 <化合物設計とリアルタイム分析> ■個人向けのワークベンチとしても複数のサイエンティストによる  ブレーンストーミングとしても使用可能 ■描画した構造の物性や既知の類似化合物の情報などをリアルタイムで表示 ■既存化合物ライブラリーデータとの比較や絞り込み、三次元構造の  描画によるファーマコフォアモデルの検討まで、高速にアイデアをレビュー ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学構造検索エンジン『JChem Engines』

ケミカルインテリジェンスでオブジェクトリレーショナルデータベース管理システムを強化

『JChem Engines』は、化学構造の表示、検索、保存、構造および 非構造データ管理機能のための高度な実装を提供します。 データ管理機能は、ChemAxonアプリケーションの多種多様な統合システム全体に広く埋め込まれたコアエンジンであり、研究情報科学システムが依存する高速で目に見えないバックボーンを提供します。 「ケミカルインテリジェンス」をバックエンドで提供し、さまざまなデータベース管理システムに化学情報を格納。複雑な構造・反応検索をはじめとする化学構造を処理するための高度な機能を提供します。 【特長】 ■研究情報科学システムが依存する高速で目に見えないバックボーンを提供 ■「ケミカルインテリジェンス」をバックエンドで提供 ■さまざまなデータベース管理システムに化学情報を格納 ■化学構造を処理するための高度な機能を提供 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化合物登録システム『Compound Registration』

製剤、混合物、ポリマーに対応した化合物登録アプリケーションのご紹介です!

『Compound Registration』は、一連のWebサービスに基づいて構築された システムです。 新規の低分子化合物について、既にデータベースに格納されている化合物と 比較し、一意性を確認し、化合物番号の発番やロット番号の発番を行います。 一意性の決定は、構成可能な企業のビジネスロジックに従って行われます。 【特長】 ■一連のWebサービスに基づいて構築されたシステム ■関連する構造情報と付随情報を格納するように設計されたデータベースが  含まれている ■問題を自動的に修正できない場合は、ステージング領域に分類 ■登録が成功すると、化合物を3レベルの階層に格納できる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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海外法規制チェック『Compliance Checker』

世界の化学物質法令確認を確実・簡単に!構造式から世界の薬物規制を瞬時にチェック

『Compliance Checker』は、ソフトウェアシステムと法規制データベースを組み合わせたもので、調査対象の化合物が、どの国のどの法令等で規制されているかを素早く簡単に確認する方法を提供し、各国の関連法に従った適切な化合物の取扱いを確実にします。 製薬会社をはじめ、CRO、試薬サプライヤーなど多数のユーザーで利用されており、これらのお客様からのフィードバックを常に反映して改善を重ねています。 【特長】 ■構造から世界の薬物規制を確認(18か国の関連法と5つの国際規制) ■容易なシステム間連携・スケーラビリティー ■直観的なGUI ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化学DB『Instant JChem Enterprise』

高速かつ高度な構造/反応検索をサポート!フロントエンドの機能も提供します

『Instant JChem Enterprise』は、InstantJChemは反応式や構造式などの化学情報とその関連情報を管理・検索・参照・解析する為のデスクトップアプリケーションです。 ORACLEなどの企業データベースのフロントエンドとして機能するほか、PC上にローカルデータベースの構築も可能です。 簡単な操作で化学データベースを構築し、インポート、エクスポート、ブラウジング、構造/反応検索、編集ができます。 【特長】 ■簡単な操作で化学データベースを構築 ■インポート、エクスポート、ブラウジング、構造/反応検索、編集が可能 ■pKaやlogPなどの物性計算機能をInstanJChem内で利用可能 ■構造が登録された瞬間に物性値も計算できる ■構造式の標準化機能組み込むことができる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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化合物登録システム『PatRegi|SM』で確実な化合物管理を!

お客様の組織のニーズにピッタリフィットする化合物登録システムを迅速に構築

パトコアは、化合物の登録に必要な一連のビジネスロジックを Webサービスとして提供します。 『PatRegi|SM』は、詳細なコンフィグレーション機能により、 各社の多様なビジネスポリシーに柔軟に対応。 要件定義やビジネスルールがテンプレート化されており、 短期間で システム導入いただけます。 【特長】 ■詳細なコンフィグレーション機能により、多様なビジネスポリシーに柔軟に対応 ■電子実験ノートからの化合物登録に好適 ■法規制チェックシステムCRAIS Checkerと連動 ■Instant JChemからマニュアル登録、SDFからの一括登録が可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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HSコード確認システム『cHemTS』で通関を確実に!

化学物質の輸出入統計品目「HSコード」を名前・構造式から瞬時に特定。メリットを分かりやすく紹介した資料を進呈中

『cHemTS』は化学構造式から、瞬時にHSコードを特定し確認できるシステムです。 ◎正式なIUPAC名やCAS番号がわからなくても特定できる ◎新規の化学物質でも、構造式さえあれば、HSコードを特定できる ◎複数構造の一括チェックが可能 といった特長があり、化学品のHSコードの特定作業を 専門知識が無くても早く簡単に行うことができます。 <ただいま、本システムのメリットを分かりやすく紹介した資料を配布中!> 【資料の概要】 ■HSコードとは ■化学品におけるHSコード調査の課題 ■cHemTSの各種特長  ・化学者以外でも容易に利用できる  ・APIによるシステム連携と自動化の推進  ・ビジネス上のメリット  ・セキュリティと機密性  ・対応している国と地域 ※「PDFダウンロード」より、製品資料と一緒にご覧ください。

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分子基本パラメータ計算『Elemental Analysis』

Marvinライセンスで利用可能!分子の元素構成に関する値を計算・表示します

パトコアは、分子量、化学式等の基礎項目に適した 『Elemental Analysisグループ』を取り扱っています。 分子の元素構成に関する値を計算・表示。 Marvinライセンスでご利用頂けます。 【計算・表示する値(抜粋)】 ■Mass:molecular mass ■Exact mass:molecular mass calculated from the most frequent  natural isotopes of the elements ■Formula:chemical formula of the molecule 【ご利用形態】 ■Marvin Sketchのプラグインとして ■cxcalcコマンドラインツールとして ■Chemical Termsの機能として ■Java・.NET、Microserviceなど各種APIを利用して、独自アプリケーションで利用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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分子記述子計算『Structural Calculations』

パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能なラインアップをご用意!

パトコアは、チャージ、コンフォーマーの発生、局在エネルギー等の計算に適した『Structural Calculationsグループ』を取り扱っています。 パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能な「Charge Plugin」をはじめ、「Conformation Plugin」や「Geometry Plugin」をラインアップしています。 【特長】 ■Charge Plugin:パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算 ■Conformation Plugin:コンフォマーの発生、重ね合わせ、MD計算 ■Geometry Plugin:分子の様々な幾何学的パラメータを計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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1Hおよび13C NMRスペクトル予測『NMR』

有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します!

NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に重要な役割を果たしています。 『NMRグループ』は、有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します。 【特長】 ■NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に  重要な役割を果たしている ■有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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水溶解度予測『Solubility』高精度で予測!

高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です!

溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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立体異性体、互変異性など、各種異性体構造の生成『Isomers』

互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成!ヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須

パトコアは、互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成に適した 『Isomersグループ』を取り扱っています。 多くの化合物データベースは、立体化学や互変異性体の情報が不完全な 2D構造により構成されていますが、この為これらの化合物を3次元化する際、 いや応なく立体化学や互変異性の曖昧さを招きます。 互変異性体や立体異性体のエニュメレーションはドッキングや3Dサーチ、 3D-QSARなどのヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須となります。 【ラインアップ】 ■Stereoisomer Plugin:立体異性体を生成 ■Tautomer Plugin:互変異性体の計算 ■Resonance:共鳴構造の生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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LogP予測,LogD予測『Partitioning』

logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います!

『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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pKa予測・分子種予測・等電点予測『Protonation』

イオン化され得るグループのpKaを計算!蛋白などに対しても利用できます

当社は、pKa(酸塩基解離定数)等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa:高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies:特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point:等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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hERG阻害予測ツール『hERG Predictor』

信頼性の高いhERG阻害予測ツールで、心毒性リスクを創薬の早期に排除します!

創薬プロジェクト全般にわたって、薬物動態と毒性パラメータの最適化は 重要な目標となります。 『ADMETグループ』は、機械学習の手法をキュレーションされた データセットに適用し、信頼性の高い予測モデルを作成。 トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測することにより、 候補化合物に対する心毒性リスクを評価できます。 【特長】 ■機械学習の手法をキュレーションされたデータセットに適用 ■信頼性の高い予測モデルを作成 ■トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測 ■候補化合物に対する心毒性リスクを評価できる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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高精度物性予想『Calculator Plugins』

薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価!プロパティー計算プラグイン

『Calculator Plugins』は、高いパフォーマンスと多様な活用法を実現する、統合テクノロジーをベースにしたケムインフォマティクスツールキットです。 実装することで可能となる計算や特性予測は、数十万の化合物であっても薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価し、強力なリード生成・リード最適化ツールとなるでしょう。 当製品群は、“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれており、計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでご契約いただけます。 【特長】 ■高いパフォーマンスと多様な活用法を実現 ■薬学的に関連する物理化学的特性と分子記述子を効率的に評価 ■強力なリード生成・リード最適化ツール ■“バンドル”と呼ばれる6つのグループに分かれている ■計算したい項目に応じて必要なバンドルを選んでできる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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バイオアプリ用API『Biomolecule Toolkit』

HELMでバイオ分子の完全なハンドリングを実現!明確な表現を可能にします

『Biomolecule Toolkit』は、ADCやペプチドといった複雑なバイオ分子の取扱いにおいて、化学的情報と生物学的情報を隔てるギャップを橋渡しするHELMベースのウエブサービスベースのツールです。 的確なバイオ分子の格納、索引付け、データベース内検索が可能。 既存のバイオロジックス管理プラットフォームを拡張したり、バイオ分子登録システムの基盤としてご利用になれ、お客様独自のワークフローやビジネスロジックに合わせて、バイオ分子の正規化、登録、検索機能などを利用できます。 【特長】 ■化学的情報と生物学的情報を隔てるギャップを橋渡しする ■的確なバイオ分子の格納、索引付け、データベース内検索が可能 ■既存のバイオロジックス管理プラットフォームを拡張 ■バイオ分子登録システムの基盤として利用可能 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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