当社は、pKa（酸塩基解離定数）等の予測に適した『Protonationグループ』を取り扱っています。 高精度のpKa計算プログラム「pKa」をはじめ、特定のpHにおける主要構造を予測する「Microspecies」や、等電点の計算が可能な「Isoelectric point」をラインアップしています。 【ラインアップ】 ■pKa：高精度のpKa計算プログラム ■Microspecies：特定のpHにおける主要構造を予測 ■Isoelectric point：等電点の計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

『Partitioningグループ』は、水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測することができます。 logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測を行います。 適用された改変には、電子非局在化を調整する為に選択された原子タイプの再定義(特に硫黄、炭素、窒素および金属原子)やイオン化フォームの考慮等が含まれます。 【特長】 ■水/オクタノール分配係数に加え、pHに依存するlogD値を予測 ■logP、logDともに改良されたViswanadhanらの方法に基づき予測 ■両性イオンのlogP値は等電点でlogDから計算 ■logD値がpH依存のように、logD計算はpKa予測の方法に依存 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

溶解性は、創薬において分子の吸収と分布のカギとなる重要なファクターのひとつであることから、常に最適化の対象となります。 そのため高精度の溶解度予測ツールは、開発の初期段階においてきわめて重要です。 【特長】 ■入力した分子のトポロジーに基づいて溶解度を予測 ■各pHレベルにおける溶解性を計算 ■大まかな予測のみが知りたい場合などに便利 ■非常に高精度な予測結果を示した ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

創薬プロジェクト全般にわたって、薬物動態と毒性パラメータの最適化は 重要な目標となります。 『ADMETグループ』は、機械学習の手法をキュレーションされた データセットに適用し、信頼性の高い予測モデルを作成。 トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測することにより、 候補化合物に対する心毒性リスクを評価できます。 【特長】 ■機械学習の手法をキュレーションされたデータセットに適用 ■信頼性の高い予測モデルを作成 ■トレーニング済みモデルを用いてhERG阻害を予測 ■候補化合物に対する心毒性リスクを評価できる ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

パトコアは、チャージ、コンフォーマーの発生、局在エネルギー等の計算に適した『Structural Calculationsグループ』を取り扱っています。 パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算が可能な「Charge Plugin」をはじめ、「Conformation Plugin」や「Geometry Plugin」をラインアップしています。 【特長】 ■Charge Plugin：パーシャルチャージ、分極率、電気陰性度の計算 ■Conformation Plugin：コンフォマーの発生、重ね合わせ、MD計算 ■Geometry Plugin：分子の様々な幾何学的パラメータを計算 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

パトコアは、互変異性体、立体異性体、共鳴構造の生成に適した 『Isomersグループ』を取り扱っています。 多くの化合物データベースは、立体化学や互変異性体の情報が不完全な 2D構造により構成されていますが、この為これらの化合物を3次元化する際、 いや応なく立体化学や互変異性の曖昧さを招きます。 互変異性体や立体異性体のエニュメレーションはドッキングや3Dサーチ、 3D-QSARなどのヴァーチャルスクリーニングへの適用に必須となります。 【ラインアップ】 ■Stereoisomer Plugin：立体異性体を生成 ■Tautomer Plugin：互変異性体の計算 ■Resonance：共鳴構造の生成 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に重要な役割を果たしています。 『NMRグループ』は、有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測します。 【特長】 ■NMRスペクトルの予測は、構造のバリデーションや分子の説明に 　重要な役割を果たしている ■有機化合物における1Hおよび13C NMRスペクトルを予測 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

パトコアは、分子量、化学式等の基礎項目に適した 『Elemental Analysisグループ』を取り扱っています。 分子の元素構成に関する値を計算・表示。 Marvinライセンスでご利用頂けます。 【計算・表示する値(抜粋)】 ■Mass：molecular mass ■Exact mass：molecular mass calculated from the most frequent 　natural isotopes of the elements ■Formula：chemical formula of the molecule 【ご利用形態】 ■Marvin Sketchのプラグインとして ■cxcalcコマンドラインツールとして ■Chemical Termsの機能として ■Java・.NET、Microserviceなど各種APIを利用して、独自アプリケーションで利用 ※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

「Trainer Engine」は、高精度の予測モデルを構築・展開し、隠された化学構造と活性値などとの関係性を見出すことができます。 また、各種機械学習アルゴリズムに対応しており、化学データを自動的に正規化して高性能な記述子を生成します。最も重要な統計パラメータは回帰と分類の両方のケースで計算されます。 再現性と可視化にも優れており、モデルをリポジトリに一元管理することで、再現性が確保されパラメータの比較を容易にします。分析ビューの表示形式も各種用意があるので、目的に応じて設定が可能です。 【特長】 ■データの取り込み～検証済みモデルの組織内展開までカバーする網羅性 ■構造式の標準化と高品質でカスタマイズ可能な記述子を利用する聡明さ ■モデル最適化のための豊富なフィードバックと可視化可能な利便性 ■セントラルリポジトリで採用モデルの選定を支援する再現性 ■内臓のグラフィカルインターフェース、その他デザインプラットフォームから予測機能にアクセス可能な統合性 ■生物活性、ADMET、物理化学的性質の予測が可能