Lasergene Molecular Biology

基本情報

【収録アプリケーション】 ・SeqBuilder Pro：配列編集、アノテーション、プラスミドマップ、プライマー設計、in silicoクローニング ・MegAlign Pro：マルチプル／ペアワイズアライメント、系統解析 ・SeqMan Ultra：サンガー配列のアセンブリ、波形確認、トリミング ・SeqNinja：配列の一括編集、翻訳、形式変換 【動作環境】 Windows／macOS対応。 対応OS・必要構成の詳細はお問い合わせください。 【主な対応形式】 FASTA、GenBank、ABI、SCFなど。 SeqBuilder ProではSnapGene、Geneious、Vector NTI由来のファイルの読み込みにも対応。 ※入出力形式・対応範囲はアプリケーションにより異なります。

価格情報

価格はお問い合わせください。 ご利用区分、ライセンス形態、利用人数などに応じてお見積もりいたします。

納期

~ 1週間

※ライセンス形態やお手続きの内容により異なります。詳細はお問い合わせください。

用途／実績例

【主な用途】 ・配列編集、アノテーション、プラスミドマップ作成 ・PCRプライマー設計、in silicoクローニング ・サンガー配列の波形確認・アセンブリ ・マルチプルアライメント、系統解析 【国内の導入実績】 製薬企業、大学、研究機関で導入されています。 【Lasergene製品群の海外利用・提供事例】 米国国立がん研究所（NCI）、ハーバード大学医学部、ノースウェスタン大学、コーネル大学、ピッツバーグ大学、ノースカロライナ大学チャペルヒル校、オハイオ州立大学、ミシガン大学、アイオワ大学などで、利用案内やライセンス提供情報が公開されています。 ※海外の事例は各機関の公開情報に基づきます。対象パッケージは機関により異なり、当社からの販売実績を示すものではありません。

詳細情報

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  【配列編集・プラスミドマップ作成】 SeqBuilder Proでは、配列の編集・アノテーションと、プラスミドマップの作成を行えます。 制限酵素認識部位、遺伝子などのフィーチャー、翻訳結果の表示をカスタマイズし、配列の構成を視覚的に確認できます。実験に用いる配列の整理や、研究資料に掲載するマップの作成を支援します。

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  【配列比較・系統解析】 MegAlign Proは、DNA・タンパク質配列のマルチプルアライメントとペアワイズアライメントに対応します。Clustal Omega、Clustal W、MAFFT、MUSCLEなどの手法を利用できます。 アライメントの編集・トリミング、配列間の相違の確認、系統樹の作成までを支援します。系統解析では、近隣結合法（BIONJ）と最尤法（RAxML、RAxML-NG、IQ-Tree）を利用できます。

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  【サンガー配列の確認・アセンブリ】 SeqMan Ultraは、参照配列の有無に応じたサンガーシーケンスデータのアセンブリに対応します。 波形データの確認、手動・自動トリミング、リードのアライメントやカバレッジの評価を行えます。作製したプラスミドやコンストラクトなどの配列確認を支援します。

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  【プライマー設計・仮想クローニング】 SeqBuilder Proは、PCRプライマーやプローブの設計・カスタマイズ、in silicoクローニングに対応します。 Golden Gate、Gibson Assembly、In-Fusion、Gateway、TOPO cloning、TA cloning、制限酵素を用いるクローニングなど、各種手法による実験計画を支援します。 プライマーカタログの作成・共有にも対応し、研究室内でのプライマー情報の整理に活用できます。

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  【自動アノテーション・配列の一括編集】 SeqBuilder Proは、プラスミドの自動アノテーションと配列の一括編集に対応します。 厳選されたアノテーションデータベースに加え、独自に作成・管理するデータベースも利用できます。複数の配列を扱う際の情報整理や、繰り返し行う編集作業を支援します。

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  【配列データベース・BLAST検索】 SeqBuilder Proは、NCBI BLASTによる配列類似性検索と、Entrezによるテキスト検索に対応します。 手元の配列ファイルやNCBIから取得した配列を利用して、ローカルデータベースを作成・管理することも可能です。ローカル検索はインターネットに接続せずに実行でき、研究室で蓄積した配列群からの類似配列検索に活用できます。

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  【ゲル電気泳動シミュレーション】 SeqBuilder Proは、ゲル電気泳動のシミュレーションに対応します。 アガロースゲル内でのDNA断片の移動をシミュレートし、予想されるバンドパターンの確認に利用できます。制限酵素解析やクローニングに関連する実験計画の検討を支援します。

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  【他ソフトウェア由来の配列ファイルを活用】 SeqBuilder Proは、FASTA、GenBank、ABIなどの配列ファイルに加え、SnapGene、Geneious、Vector NTI由来のファイルの読み込みに対応します。 既存の配列データを活用しながら、配列編集、プラスミドマップ作成、クローニング設計を進められます。 ※読み込める情報や対応範囲は、ファイル形式・内容によって異なります。

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  【電子実験ノート「SciNote」と連携】 SeqBuilder Proは、電子実験ノート（ELN）「SciNote」との連携に対応します。 SeqBuilder ProのデータをSciNoteに転送・管理し、分子生物学の実験設計と実験記録をつなげられます。研究データの整理、共同作業、トレーサビリティの向上を支援します。 ※連携機能の利用にはSciNoteの有料プランが必要です。

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