支援システム×パトコア株式会社 - List of Manufacturers, Suppliers, Companies and Products

支援システム Product List

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構造アイディア提示システム『Transformer』最適化を加速

MMP解析などによって得られた置換ナレッジに基づき、構造改変アイディアを提示!

『Transformer』は、入力した構造をルールに基づき変換し、今まで思い付かなかった構造を自動生成する アイディア提示システムです。 “リード化合物のSolubilityなどの物性値を改良したい”、“ターゲットに対する生化学的特性を変化させたい”といった構造好適化段階の化合物設計において威力を発揮。 構造変換ルールベースとしてEMILを標準実装しているほか、ChEMBLデータベースやお客様が自社内で蓄積している 化合物ライブラリーのデータもインポートして活用することができます。 【特長】 ■入力した構造をルールに基づき変換 ■構造好適化段階の化合物設計において威力を発揮 ■構造変換ルールベースとしてEMILを標準実装 ■ChEMBLデータベースやお客様が自社内で蓄積している化合物ライブラリーのデータもインポートして活用可能 ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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骨格分類、SAR解析支援ツール『SARvision SM』

骨格は予めリストとして与えることが不要!読み込まれた化学構造式から自動的に生成

『SARvision SM』は、化学者にとって重要な仕事のひとつである 構造活性相関の検討を支援するソフトウェアです。 独自の最大共通部分構造(MCS:Maximum Common Substructure) 抽出エンジンにより化学構造データを骨格ごとに分類することができ、 SARの検討が容易。 骨格ベースのデータマイニングは、記述子ベースのクラスタリングに 比べて化学者の感性に近い評価が行え、スクリーニングデータの評価や Hit to Leadやリード最適化ステージでの合成戦略の立案などに力を発揮します。 【NEW!】 バイリガンドのSAR研究をルーチン化、かつ容易に実行できるPROTAC解析モジュールがリリースされました。 詳細は製品ページをご覧ください。 【特長】 ■構造式群から自動的に共通部分骨格を抽出し、  骨格ごとに分類したツリーを提示 ■骨格を物性や活性データでソートしたり、  スライダーを使った動的な絞込み ■豊富なグラフィック機能(棒グラフ、2D散布図、3D散布図) ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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マーカッシュ構造データベース検索『Markush search』

DARC formatのインポート機能を実装!マーカッシュ構造のケミカルスペースを瞬時に検索

『Markush search』は、特許出願などに用いられるマーカッシュ構造を データベースに登録し、エニュメレーションすることなく、部分構造検索や 完全一致検索を実現するJChem Base、JChem Cartridgeおよび Instant JChem用のアドオンです。 Markush Enumeration pluginの2つのツールを用いることにより、 複雑なマーカッシュ構造の解析やマーカッシュ構造によって記述された ケミストリースペースのブラウジングを格段に容易にします。 また、DARC formatのインポート機能を実装しており、Tomson Reuters社の 提供する特許のデータベースMMSを利用することができます。 【特長】 ■部分構造検索や完全一致検索を実現 ■ケミストリースペースのブラウジングを格段に容易にする ■DARC formatのインポート機能を実装 ■Tomson Reuters社の提供する特許のデータベースMMSを利用できる ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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『JChem extensions for KNIME』

ChemAxonの機能をKNIMEに統合!分析プロセス全体の使いやすいグラフィカルなワークベンチ

『KNIME』は、データアクセス、データ変換、初期調査、強力な予測分析、 ビジュアライゼーション、およびレポート作成など、分析プロセス全体の 使いやすいグラフィカルなワークベンチです。 創薬分野に限らず一般的な目的で設計されており、基本的なセットアップには 多くの分野で共通の機能が含まれていますが、同時に多くのケムインフォマ ティクスおよびバイオインフォマティクス関連の拡張ツールがあり、 とくに創薬初期で有用な化学構造管理や分析などに広く活用されています。 【特長】 ■研究者がKNIMEワークフロー内でChemAxonツールを  活用できるようになる ■創薬分野に限らず一般的な目的で設計 ■とくに創薬初期で有用な化学構造管理や分析などに  広く活用されている ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。

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